清华大学深圳研究生院成立于2001年,是清华大学与深圳市合作创办的异地研究生院,承担研究生培养、科学研究与社会服务职能。该院依托清华学科基础,结合深圳产业需求,重点建设信息技术、生命健康、新材料、海洋工程等方向。2004年起招收硕士研究生,2006年启动博士研究生培养。2014年,清华大学与深圳市签署协议,在研究生院基础上共建清华大学深圳国际研究生院。该院实行理事会领导下的院长负责制,采用“双基地”模式,与校本部资源共享。截至2023年,设有7个学部,拥有30余个科研平台,累计培养毕业生超万名。